1994 Yerel seçimlerinden İBB başkanı Recep tayyip Erdoğan İle birlikte İBB meclisine seçilen Erdoğan Bayraktar Başkan Erdoğan’ın talebi üzerine KİPTAŞ Genel müdürlüğüne getirilir deyim yerindeyse KİPTAŞ’ı yoktan var ederek 100 binlerce insanı ev sahibi yapan   Bayraktar Başkan Erdoğan’ın yasaklı olmasıyla yerine seçilen Ali Müfit Gürtuna ile yollarını ayırıp Ankara metropol’un başına gelir çok geçmeden orada‘da müthiş içraatlara imza atan Bayraktar AK Parti iktidarıyla yeniden kamuya döner TOKİ’nin başına getirilir 1 yıl içinde ülke çapında 330 Şantiye kuran Başkan bayraktar ilk olarak memleketi Trabzon’da yıldızlı TOKİ bahçecik -1 ve bahçecik-2 TOKİ konutlarını başlatırken özellikle Kentsel dönüşüm projelerine  önem verir Zağnos ve tabakhane vadileri projeleri,kanunu eğitim araştırma hastanesi yolu ile birlikte Haçkalı hoca baba devlet hastanesi ve Ağız ve diş sağlığı merkezi ülke çapındaki sağlık yatırımlarının,Şenol Güneş Stadyumu spor yatırımlarının bazılarıdır,10 yıl sonunda Başbakan Erdoğan’a Ben bir koltukta 5 yıldan fazla oturmayı uygun bulmuyorum eğer uygun görürseniz TOKİ Başkanlığından ayrılmayı düşünüyorum der ne yapmayı düşünüyorsun diye sorunca Ben piyasadan gördüm piyasaya dönerim özellikle Arap aleminde çok büyük çevrem var orada gidip iş kurmayı düşünüyorum deyince, Allah ömür verirse parayı sonra kazanırsın sana ihtiyacımız var trabzon’da milletvekili olmanı istiyorum deyince 2011 genel seçimlerinde Trabzon milletvekili ve Çevre şehircilik Bakan olur bu Bakanlığı yeniden kurar Özellikle Van depreminde çok kısa sürede portatif camiler ve okullar kuran çok kısa sürede Yüzlerce insanı ev sahibi yapan yıkılan bir şehiri yeniden bir başka alana kuran Bakan bayraktar’a vatandaşlar keşke siz bizim Milletvekilimiz olsaydınız diye yüksek ses ile methiyelerini bildirirler Kendisi iste mütevazılığı asla elden bırakmasg feto terör örgütünün bir iş aramaç kendisi ise mütevazılığı asla evde bırakmaz (hani ne istediniz de vermedik denilen )fetoculara bir tek iş ve bir metre kare arsa vermeyen Bakan Bayraktar’ın 17/25 operasyonu yapılır asıl hedef ise Başbakan Recep Tayyip Erdoğan ve yakınlarıdır bir gün sonra da Bilal Erdoğan’ı almak için özel ekip gönderenlere anında müdahale edilmiş,Bakan Bayraktar’ın ise istifası istenmiştir siz ne istedi iseniz yaptım deyincede görevden azledilmiştir davasına küsmemiş başkaları gibi koşup bir başka partiye gitmemiş beni hırsızlar ile aynı cuvala atmayın demiştir muhalefet dahil tüm kamuoyu kendisini desteklemiş kamu vicdanında berat etmiştir Bayraktar görev adamıdır Doğup büyüdüğü şehrine Alemdar camii ve külliyesini kazandırmak üzere kollarını sıvamıştır hayallerimin projesi dediği o büyük eserin kaba inşaatı bitmiştir,Şehrin dört bir tarafından görülebilen bu büyük eser ile bu aziz şehirdeki hizmetlerini taçlandıracaktır ancak bu şehir seni çok arayacaktır Sayın Erdoğan Bayraktar.